Eu estava a busca de alguma ferramenta que convertesse do Sqlite3 (baseado exclusivamente em arquivo) para o MySQL e achei no Stack Overflow.

Adiante transcrevo o conteúdo do script perl que faz a conversão:

#! /usr/bin/perl

# From: http://stackoverflow.com/questions/18671/quick-easy-way-to-migrate-sqlite3-to-mysql

while ($line = <>){
    if (($line !~  /BEGIN TRANSACTION/) && ($line !~ /COMMIT/) && ($line !~ /sqlite_sequence/) && ($line !~ /CREATE UNIQUE INDEX/)){

    	if ($line =~ /CREATE TABLE \"([a-z_]*)\"(.*)/){
    		$name = $1;
    		$sub = $2;
    		$sub =~ s/\"//g;
    		$line = "DROP TABLE IF EXISTS $name;\nCREATE TABLE IF NOT EXISTS $name$sub\n";
    	}
    	elsif ($line =~ /INSERT INTO \"([a-z_]*)\"(.*)/){
    		$line = "INSERT INTO $1$2\n";
    		$line =~ s/\"/\\\"/g;
    		$line =~ s/\"/\'/g;
    	}else{
    		$line =~ s/\'\'/\\\'/g;
    	}
    	$line =~ s/([^\\'])\'t\'(.)/$1THIS_IS_TRUE$2/g;
    	$line =~ s/THIS_IS_TRUE/1/g;
    	$line =~ s/([^\\'])\'f\'(.)/$1THIS_IS_FALSE$2/g;
    	$line =~ s/THIS_IS_FALSE/0/g;
    	$line =~ s/AUTOINCREMENT/AUTO_INCREMENT/g;
    	print $line;
    }
}

Para usar basta indicar o arquivo exportado do Sqlite3 como primeiro argumento e redirecionar a saída padrão para um arquivo, i. e.:

$ sqlite32mysql from_sqlite3.sql > to_mysql.sql

Convertido.